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Introducción: Las aplicaciones web actualmente son indispensables para el manejo de los datos en toda organización, permite al usuario acceder y utilizar la información desde cualquier parte del mundo. El uso de las aplicaciones web ha propiciado la agilización de varios procesos. Objetivo: Emplear una aplicación web desarrollada mediante software libre para el control y clasificación de historias clínicas por diferentes patologías del Centro Médico Salud y Vida de Ibarra, Ecuador. Método: Se aplicó una investigación de modalidad mixta cualitativa-cuantitativa la misma que permitió identificar necesidades reales de los pacientes y de los profesionales de esta casa de salud. El uso de la investigación histórica ayudó a conocer cada uno de los procesos que fueron tomados en cuenta en la generación de la historia clínica y cómo poder clasificarlas por patologías. Con ayuda de la investigación bibliográfica se logró recopilar definiciones necesarias para argumentar la base teórica del artículo; a través de la encuesta y entrevista se identificó la disconformidad de los pacientes por factores como el tiempo de espera, la deficiencia de búsqueda y peor aún no encontrarse registrados. Resultados: La agilidad en los procesos de registro de los pacientes y cada uno con su respectiva historia clínica permite que en las próximas citas los especialistas continúen con su diagnóstico. Conclusiones: La aplicación web agiliza de manera efectiva los procesos relacionados a las historias clínicas, lo que contribuye al control y clasificación de dicha documentación.